Главная / Налогообложение аптеки: выбор системы налогообложения

Бизнес аптеки Налоги и учёт

Налогообложение аптеки: выбор системы налогообложения

Правильный выбор системы налогообложения — одно из ключевых решений при открытии и ведении аптечного бизнеса. От этого зависит налоговая нагрузка, объём отчётности и конкурентоспособность аптеки. В этом материале разберём все доступные режимы, их ограничения для фармацевтической деятельности и практические рекомендации по выбору.

Особенности налогообложения в фармацевтической отрасли

Аптека — это не обычная розничная точка. Реализация лекарственных препаратов, изделий медицинского назначения и биологически активных добавок регулируется отдельными нормами Налогового кодекса РФ. Ключевые особенности:

Льготный НДС — лекарственные препараты из перечня ЖНВЛП облагаются по ставке 10%, а не 20%.
Смешанный ассортимент — аптека может продавать товары с разными ставками НДС (0%, 10%, 20%), что усложняет учёт.
Лицензируемая деятельность — наличие фармацевтической лицензии влияет на доступность ряда налоговых режимов.
Маркировка — обязательная маркировка лекарств требует интеграции с ГИС «Честный знак», что сказывается на системе учёта.

Аптекарь за прилавком аптеки работает с документами и кассовым аппаратом

⚠ Важно знать

С 2021 года аптеки утратили право применять ЕНВД. Это вынудило многих предпринимателей пересмотреть систему налогообложения и перейти на УСН или ОСНО.

Доступные системы налогообложения для аптеки

Сравнение основных режимов с учётом специфики фармацевтической деятельности

Режим	Ставка налога	Ограничения	НДС	Подходит аптеке
ОСНО	20% (прибыль) + НДС	Нет ограничений	Да, 10%/20%	✓ Да
УСН «Доходы»	6% (регион: от 1%)	Доход ≤ 251,4 млн ₽; сотрудники ≤ 130	Нет	✓ Да
УСН «Доходы − Расходы»	15% (регион: от 5%)	Доход ≤ 251,4 млн ₽; сотрудники ≤ 130	Нет	✓ Да
Патент (ПСН)	6% от потенц. дохода	Только ИП; сотрудники ≤ 15; доход ≤ 60 млн ₽	Нет	✓ Да (ИП)
ЕСХН	6% от прибыли	Только с/х производители	Нет	✗ Нет

* Лимиты УСН актуальны на 2024–2025 гг. с учётом коэффициента-дефлятора. Уточняйте действующие значения на сайте ФНС России.

Детальный разбор каждого режима для аптеки

ОСНО — общая система налогообложения

Обязательна для крупных аптечных сетей и компаний, работающих с корпоративными клиентами (больницы, клиники), которым нужен входящий НДС. На ОСНО аптека платит налог на прибыль (20%), НДС и налог на имущество.

Плюсы

— Льготная ставка НДС 10% на ЖНВЛП
— Возможность вычета входящего НДС от поставщиков
— Нет ограничений по обороту и числу сотрудников
— Подходит для аптечных сетей любого масштаба

Минусы

— Высокая налоговая нагрузка
— Сложный учёт: раздельный НДС по разным ставкам
— Большой объём отчётности
— Требует профессионального бухгалтера

УСН «Доходы» (6%)

Подходит аптекам с высокой маржинальностью и небольшими подтверждёнными расходами. Налог рассчитывается с выручки без учёта затрат, но можно уменьшить его на уплаченные страховые взносы (до 50% для ООО, полностью — для ИП без сотрудников).

Когда выгодно: если расходы составляют менее 60% от выручки. Типична для небольших аптек с ограниченным персоналом и невысокой арендой.

УСН «Доходы минус Расходы» (15%)

Наиболее распространённый режим для аптек на УСН. Учитываются все документально подтверждённые расходы: закупка товара, аренда, зарплата, страховые взносы, обслуживание ПО. Ставка 15% может быть снижена региональным законом до 5%.

Когда выгодно: если расходы превышают 60% выручки — что характерно для большинства аптек с высокой долей закупки товара.

Минимальный налог: даже при убытке аптека обязана уплатить 1% от доходов. Убыток можно переносить на следующие периоды до 10 лет.

Патентная система (ПСН) — только для ИП

Патент на розничную торговлю фармацевтическими товарами доступен индивидуальным предпринимателям. Стоимость патента фиксирована и определяется регионом. Не нужно сдавать декларацию, ведётся только книга учёта доходов.

Ограничения ПСН: площадь торгового зала ≤ 150 м², не более 15 наёмных работников, годовой доход ≤ 60 млн ₽.

Совмещение: ПСН можно совмещать с УСН, чтобы охватить деятельность, не подпадающую под патент (например, изготовление лекарств).

Как выбрать систему налогообложения для аптеки: пошаговый алгоритм

Определите организационно-правовую форму

ИП имеют доступ к ПСН; ООО — только ОСНО или УСН. Аптека как ООО чаще выбирает УСН «Доходы − Расходы» или ОСНО.

Оцените планируемый оборот

Если оборот превысит лимит УСН — придётся перейти на ОСНО. Для крупной сети сразу планируйте ОСНО.

Проанализируйте долю расходов

Рассчитайте: расходы / выручка × 100%. Если > 60–65% — выгоднее УСН 15%; если < 60% — рассмотрите УСН 6% или ПСН.

Проверьте региональные льготы

Многие регионы снижают ставку УСН для фармацевтической деятельности. Проверьте региональный закон — ставка УСН «Д−Р» может быть 7–10%.

Учтите работу с юрлицами

Если аптека планирует поставки в больницы или клиники, которым нужен НДС — ОСНО становится обязательным или предпочтительным режимом.

Схема сравнения систем налогообложения для аптеки: ОСНО, УСН, ПСН на доске с расчётами

«Для большинства небольших аптек (ИП или ООО с одной точкой) оптимальным выбором остаётся УСН "Доходы минус расходы" по ставке 15%. Это сочетание разумной налоговой нагрузки, относительно простой отчётности и возможности учесть все реальные затраты бизнеса.»

— Практика налогового консультирования аптечного бизнеса

Часто задаваемые вопросы о налогообложении аптеки

Может ли аптека применять самозанятость (НПД)?

Нет. Налог на профессиональный доход (НПД) не предназначен для торговли товарами, в том числе лекарственными препаратами. Самозанятость разрешена только для услуг и продажи товаров собственного производства. Аптека — это розничная торговля, поэтому НПД недоступен.

Как часто можно менять систему налогообложения?

Перейти с УСН на другой режим можно один раз в год — с 1 января следующего года. Уведомление в ФНС подаётся до 31 декабря. Переход на ОСНО при превышении лимита УСН происходит автоматически с начала квартала, в котором допущено превышение. Патент оформляется отдельно на срок от 1 до 12 месяцев.

Нужна ли онлайн-касса для аптеки на УСН или ПСН?

Да, онлайн-касса обязательна для всех аптек вне зависимости от системы налогообложения. Фармацевтические организации также обязаны работать с маркировкой через систему «Честный знак» и передавать данные в МДЛП. Касса должна поддерживать передачу кодов маркировки.

Как аптека на УСН учитывает НДС от поставщиков?

Аптека на УСН не является плательщиком НДС и не может принять входящий НДС к вычету. НДС, предъявленный поставщиком, включается в стоимость товара и учитывается в расходах при УСН «Доходы − Расходы». Это незначительно увеличивает закупочную себестоимость по сравнению с режимом ОСНО, но компенсируется меньшей общей налоговой нагрузкой.

Есть ли налоговые льготы для аптек, торгующих ЖНВЛП?

На ОСНО — да: ставка НДС 10% вместо 20% на препараты из перечня ЖНВЛП, на изделия медицинского назначения и некоторые виды медтехники. Кроме того, аптечные организации, имеющие лицензию, при численности работников с фармацевтическим образованием не менее 50% вправе применять пониженные ставки страховых взносов (в рамках действующего законодательства). На УСН льготы по НДС не актуальны, так как аптека его не платит.

Какую систему выбрать для аптечного пункта в сельской местности?

Для небольшого аптечного пункта в сельской местности с ИП-владельцем часто оптимальна ПСН: фиксированная и невысокая стоимость патента, минимум отчётности. Если оборот и число сотрудников укладываются в лимиты — это выгоднейший вариант. Дополнительно стоит проверить, не действует ли в регионе нулевая ставка УСН для новых ИП («налоговые каникулы»).

10%

льготная ставка НДС на лекарства из перечня ЖНВЛП

15%

максимальная ставка УСН «Доходы − Расходы» (может быть снижена регионом)

60%

пороговая доля расходов для выбора между УСН 6% и УСН 15%

Нужна помощь с выбором системы налогообложения для вашей аптеки?

Получите профессиональную консультацию по налоговому планированию для аптеки. Наши эксперты помогут рассчитать оптимальную нагрузку, учесть региональные льготы и подготовить документы для перехода на выгодный режим.

Материал носит информационный характер. Налоговое законодательство регулярно меняется. Перед принятием решений рекомендуем проконсультироваться с квалифицированным налоговым консультантом или изучить актуальные нормы на официальном сайте ФНС России (nalog.gov.ru).